Przygotowanie próbek RNA

Przygotuj świeży bufor dodając:

• 0,75 ml zdejonizowanego formamidu (niezdejonizowany pachnie amoniakiem i/lub jest żółty).
• 0,15 ml buforu 10xMOPS-EDTA
• 0,24 ml formaldehydu
• 0,1 ml wody wolnej od RNaz
• 0,1 ml 80% glicerolu
• 0,08 ml 10% lub 2% w/v Bromophenol blue.

Taki bufor niektórzy przechowują w -20oC w ependorfówkach, ale tak przechowywany bufor nie zawsze działa.

Denaturacja próbek RNA.

• Dodać 15ul buforu do 5ul próbki RNA (nie mniej niż 10 ug RNA)
• Inkubować 15 minut w 65oC.
• Przenieść do lodu.

Tak zdenaturowane RNA można przechowywać przez kilka miesięcy w -80oC.