Transfer RNA z żelu na membranę

Po elektroforezie żel płuczemy 2 razy po 20 min w 10xSSC (aby usunąć formaldehyd). Jeśli żel był barwiony bromkiem inaczej niż to opisano powyżej, to zapewne przed transferem należy go też inaczej traktować.

Transfer downwoard (``w dół'') układa się w wysokiej wanience plastikowej i składa się z następujących warstw:

1. Wanienka z 10xSSC
2. Whatman 3M⁷ po którym spływa 10xSSC.
3. Kilka warstw Whatman 3M, tak aby roztwór SSC spływający z wanienki równomiernie zwilżał żel leżący poniżej.
4. Żel obłożony dookoła parafilmem. Parafilm uniemożliwia przepływ roztworu poza żelem.
5. Filtr nylonowy (na nim zatrzymuje się RNA przemieszczające się z buforem przepływającym przez żel).
6. Kilka warstw Whatman 3M (umożliwia równomierny odpływ buforu 10xSSC, który przesącza się z membrany powyżej).
7. Szeroki pasek Whatmana 3M umożliwiający spływanie buforu na dno wanienki.
8. Stolik (np. plastikowe pudełko lub warstwa celulozowych gąbek) dostatecznie wysoki, aby spływający z góry bufor nie zatopił nam transferu.